CCLOUD博客结论先行：对于大多数企业，阿里云RDS是更优选择，因其提供高可用性、易用性和成本效益，而自建MySQL更适合有特殊需求或技术能力强的团队。
1. 高可用性与稳定性
阿里云RDS提供自动备份、故障切换和监控告警等功能，确保数据库的高可用性。其底层采用分布式架构，支持多可用区部署，故障恢复时间（RTO）和恢复点目标（RPO）显著优于自建MySQL。自建MySQL需要投入大量资源实现类似功能，且稳定性难以保证。
2. 运维成本与效率
阿里云RDS提供全托管服务，包括自动扩容、性能优化和安全管理，大幅降低运维成本。自建MySQL需要专业DBA团队，涉及硬件采购、系统部署、日常维护等，人力成本和时间投入较高。对于中小型企业，RDS的托管模式更具性价比。
3. 安全性与合规性
阿里云RDS内置数据加密、访问控制和审计日志等功能，符合多项国际安全标准（如ISO 27001、GDPR）。自建MySQL需自行配置安全策略，存在配置不当导致数据泄露的风险。RDS的安全托管服务更适合对数据安全要求高的企业。
4. 灵活性与扩展性
阿里云RDS支持按需扩容，可根据业务需求快速调整实例规格和存储空间。自建MySQL扩展性较差，需提前规划硬件资源，且扩容过程复杂。RDS的弹性扩展能力更适合业务波动较大的场景。
5. 适用场景
- 阿里云RDS：适合中小型企业、初创公司或缺乏专业DBA团队的企业，以及对高可用性、安全性和运维效率有较高要求的场景。
- 自建MySQL：适合有特殊定制需求、技术能力强且愿意投入资源的企业，或对数据库性能有极致要求的场景。
总结：阿里云RDS在高可用性、运维效率、安全性和扩展性方面具有显著优势，是大多数企业的首选。自建MySQL仅适用于有特殊需求或技术能力强的团队。